Just Cause 3 již od vydání vykazuje značné problémy a tím největším je samozřejmě načítání hry. Ačkoliv na PC či Xbox One to není tak výrazné, zejména PS4 verze má loady velice dlouhé.
PS4 verze se dnes dočkala zásadního patche, který tento nešvar eliminuje. Loady se údajně zásadní zkrátí. U PC a Xbox One se dodatečného patche dočkáme v nejbližších dnech. Bohužel tyto problémy zásadně ovlivnily podvědomí hráčů o této hře a také hodnocení u kritiky.